1891 yılında Maraş'ta dünyaya geldi. Babası, eski Elazığ ve Diyarbakır valilerinden Mahmut Arifi Paşa, annesi ise Bayazıtzade Habibe Hanım'dır. İlk eğitimini Maraş'ta tamamladıktan sonra İstanbul Galatasaray Lisesi'nde öğrenim görmeye başladı; ancak İstanbul'un işgali nedeniyle eğitimini yarıda bırakıp Maraş'a döndü. Maraş Belediyesi'nde kâtip olarak çalışmaya başladı. Sütçü İmam olayının ardından şehirden ayrılarak köy köy dolaşarak Bertiz köylülerini savaşa hazırlamak için çaba sarf etti. Bulunduğu yerlerde vatan ve milletin kurtuluşu için yapılması gerekenleri anlatarak, her köyden silah tutabilen, savaşa uygun ve gönüllü olanları belirlemeye çalıştı.
Defterine kaydettiği Bertiz çetelerinin sayısı 489’a ulaşmıştı; bunların 248’i silahlı, 241’i ise silahsızdı. Bu gönüllü çetelerin eğitim alarak savaşa hazırlanması gerektiği ortaya çıktığında, İstanbul’dan yeni dönen amcasının oğlu Hakkı Bey’in oğlu Muharrem Bey, bu göreve uygun görülerek Bertiz’e çağrıldı. Muharrem Bey, teklifi kabul ederek çetelerin başına geçti. Bölgedeki çeteler, şubelere ayrılarak her bir şubenin reisi ve üyeleri belirlendi. Bu arada Maraş merkezde Müdafaa-i Hukuk Cemiyeti kurulmuş ve başkanlığına Arslan Bey seçilmişti. Bertiz Milli Teşkilat Komutanı Mehmet Zafer Bey, Arslan Bey’i tebrik etmek ve kardeşlik duygularını ifade etmek amacıyla bir mektup göndermiştir. Bayazıtzâde Mehmet Zafer Bey, Muharrem Bey ile birlikte Elbistan ve Sivas’tan temin edilen silahları Bertiz üzerinden merkezdeki Müdafaa-i Hukuk Cemiyeti üyelerine ulaştırmıştır.
128 kişilik çetesiyle birlikte Eloğlu Bababurun’a ulaşan Mehmet Zafer Bey, düşmanı burada durdurarak büyük bir başarı kazanmış ve düşman kuvvetlerinin şehre girmesine engel olmuştur. Şehir içindeki çatışmaların başlamasıyla birlikte, emrindeki birliklerle hızlı bir şekilde hareket ederek Ahır Dağı eteklerinden düşmanı kuşatmıştır.
Milli Mücadele'nin ardından 1937 yılına kadar Maraş vilayet genel meclisi sekreterliği görevini yürüten Mehmet Zafer Bey, 1937'de Ankara'ya taşınarak Dâhiliye Vekaleti'nde görev almaya başlar. Bir süre de mahalli idareler mümeyyizi (kâtip) olarak çalışır. 26 Şubat 1957'de vefat etmiştir.
